大蜜丸和水蜜丸的区别在于它们使用的粘合剂不同，体积、重量也不同。大蜜丸使用的粘合剂是蜂蜜，制作大蜜丸，需要先将蜂蜜加热至沸腾，产生粘性，这就是炼蜜，炼蜜完成之后和药粉混合搓成球形。大蜜丸体积更大，一般重三到九克。水蜜丸其实用的蜜水，而且是用药粉还有蜜水的混合剂来制成的，而且需要先用炼蜜按比例加水制成蜜水，蜜水和药粉的比例需要适中。水蜜丸的体积比大蜜丸小得多，重量和小蜜丸相差无几，都是零点五克以下。